平成１３年度決算検査報告
この独立行政法人は、農業生産の対象となる生物の生育環境に関する技術上の基礎的な調査及び研究等を行うことにより、その生育環境の保全及び改善に関する技術の向上に寄与することを目的として設置されているものである。その資本金は１３事業年度末現在で３４３億５３２６万余円（全額国の出資）となっている。
同法人の１３事業年度の貸借対照表、損益計算書及び主な業務実績は次のとおりである。
なお、同法人は、１３年４月１日、独立行政法人農業環境技術研究所法（平成１１年法律第１９４号）附則第５条の規定により国が有する権利及び義務のうち農林水産省の農業環境技術研究所に関する権利及び義務を承継して設立されたものである。
１ 貸借対照表
| 区分 | 13事業年度末 | |
| 千円 | ||
| 資産 | 35,975,679 | |
| （うち構築物） | (4,126,527) | |
| （うち土地） | (25,200,000) | |
| 負債 | 1,645,118 | |
| （うち運営費交付金債務） | (204,680) | |
| （うち資産見返負債） | (999,316) | |
| 資本 | 34,330,560 | |
| （うち資本金） | (34,353,269) | |
| （うち資本剰余金） | (△452,837)（注） |
２ 損益計算書
| 区分 | 13事業年度 | |
| 千円 | ||
| 経常費用 | 4,088,013 | |
| （うち研究業務費） | (3,549,109) | |
| 経常収益 | 4,092,517 | |
| （うち運営費交付金収益） | (3,235,996) | |
| （うち受託収入） | (649,481) | |
| 経常利益 | 4,503 | |
| 臨時損失 | 379,505 | |
| 臨時利益 | 805,129 | |
| 当期総利益 | 430,128 | |
| （利益の処分） | ||
| 積立金 | 430,128 |
３ 主な業務実績
農業生態系の持つ自然循環機能に基づいた食料と環境の安全性の確保
地球規模での環境変化と農業生態系との相互作用の解明
生態学・環境科学研究に係る基礎的・基盤的研究
なお、この法人について検査した結果、「第３章 個別の検査結果」に「独立行政法人の会計経理について、資産及び費用等の認識・計上処理を適切に行い、正確な財務諸表等の作成を期するよう是正改善の処置を要求したもの」 を、「第４章 特定検査対象に関する検査状況」に「独立行政法人の政府受託事業に係る経理について」 を掲記した。