平成１６年度決算検査報告
この機構は、高速増殖炉及びこれに必要な核燃料物質の開発並びに核燃料物質の再処理並びに高レベル放射性廃棄物の処理及び処分に関する技術の開発を計画的かつ効率的に行うとともに、これらの成果の普及等を行い、もって原子力の開発及び利用の促進に寄与することを目的として設置されているものである。その資本金は１６事業年度末現在で３兆０１６１億５０６６万余円（うち国の出資２兆９２２５億８７２７万余円）となっている。
同機構の１６事業年度の収入支出決算、損益、借入金及び主な業務実績は次のとおりである。
１ 収入支出決算
| 区分 | 16事業年度 | (15事業年度) |
| 千円 | 千円 | |
| (収入) | ||
| 収入決定済額 | 126,903,432 | 128,411,771 |
| (支出) | ||
| 支出予算現額 | 129,321,916 | 140,649,283 |
| 支出決定済額 | 126,367,287 | 126,593,892 |
| 翌事業年度繰越額 | 1,136,264 | 4,083,957 |
| 不用額 | 1,818,365 | 9,971,434 |
２ 損益
| 区分 | 16事業年度 | (15事業年度) |
| 千円 | 千円 | |
| 経常収益 | 106,400,394 | 98,173,188 |
| (うち国庫補助金収入) | (89,400,910) | (87,180,435) |
| 経常費用 | 151,597,007 | 151,906,316 |
| (うち高速増殖炉研究開発費) | (56,425,030) | (57,437,053) |
| 特別損失 | 1,419,607 | 10,970,349 |
| 当期損失金 | 46,611,070 | 64,703,477 |
| (損失金の処理) | ||
| 翌事業年度に繰越欠損金として整理 | 46,611,070 | 64,703,477 |
| (繰越欠損金 | 2,615,292,147 | 2,550,588,669) |
３ 借入金
| 区分 | 16事業年度末 | (15事業年度末) |
| 千円 | 千円 | |
| 借入金残高 | 10,982,000 | 19,554,000 |
| (市中金融機関) |
４ 主な業務実績
高速増殖炉原型炉「もんじゅ」の維持管理
高速増殖炉原型炉「もんじゅ」は６年４月に初臨界を達成後、初送電を行った。その後、７年１２月に２次主冷却系ナトリウム漏えい事故が発生したため、現在は原子炉を停止し、プラントの安全確保のため維持管理中である。
再処理施設の運転
高レベル放射性廃棄物の処理処分技術の研究開発