（単位：億円）
| 基金番号 | 所管府省庁名 | 予算の移替先 | 基金名 | 基金設置造成の原資となる国庫補助金等名 | 国庫補助金等交付額 | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 令和元年度 | 2年度 | 3年度 | 4年度 | 5年度 | 計 | |||||
| 2002 | 内閣府本府 | - | 沖縄県特定駐留軍用地等内土地取得事業 | 沖縄振興特別推進交付金 | - | - | - | - | 4 | 4 |
| 2007 | 内閣府本府 | 総務省 | 新型コロナウイルス感染症対応地方創生臨時交付金及び物価高騰対応重点支援地方創生臨時交付金による基金 | 新型コロナウイルス感染症対応地方創生臨時交付金（令和5年度は物価高騰対応重点支援地方創生臨時交付金） | - | 834 | 209 | 162 | 99 | 1306 |
| 2011 | こども家庭庁 | - | 安心こども基金 | 子育て支援対策臨時特例交付金 | - | 648 | 669 | 86 | - | 1405 |
| - | 復興庁 | - | 東日本大震災復興交付金基金 | 東日本大震災復興交付金 | 270 | 3 | - | - | - | 274 |
| 2012 | 復興庁 | 厚生労働省 | 生活拠点形成交付金基金 | 福島再生加速化交付金（長期避難者生活拠点形成） | - | 3 | - | - | - | 3 |
| 2015 | 復興庁 | 文部科学省 | 帰還・移住等環境整備交付金基金 | 福島再生加速化交付金（帰還・移住等環境整備） | 0 | 0 | 1 | 2 | 16 | 21 |
| 2016 | 復興庁 | 農林水産省 | 帰還・移住等環境整備交付金基金 | 福島再生加速化交付金（帰還・移住等環境整備） | 87 | 84 | 128 | 78 | 228 | 607 |
| 2017 | 復興庁 | 国土交通省 | 帰還・移住等環境整備交付金基金 | 福島再生加速化交付金（帰還・移住等環境整備） | 22 | 18 | 3 | 19 | 37 | 100 |
| 2018 | 復興庁 | - | 福島県民健康管理基金 | 福島再生加速化交付金 | - | - | 3 | 3 | 3 | 10 |
| 2020 | 復興庁 | 厚生労働省 | 地域医療再生基金 | 地域医療再生臨時特例交付金 | - | - | 53 | 29 | 23 | 106 |
| 2022 | 復興庁 | 農林水産省 | 被災農業者支援基金 | 原子力被災12市町村農業者支援事業補助金 | - | 9 | - | - | 8 | 17 |
| 2024 | 復興庁 | 経済産業省 | 福島県原子力災害等復興基金 | 医療機器産業拠点整備等事業費補助金 | - | - | 3 | 2 | 3 | 9 |
| 2025 | 復興庁 | 経済産業省 | 事業再開・帰還促進基金 | 被災事業者自立支援事業費補助金 | 44 | - | 14 | 15 | 1 | 75 |
| 2026 | 復興庁 | 経済産業省 | 福島県原子力災害等復興基金 | 医療福祉機器・創薬産業拠点整備事業費補助金 | - | - | 29 | 23 | 20 | 73 |
| 2028 | 復興庁 | 環境省 | 福島県民健康管理基金 | 放射線量低減対策特別緊急事業費補助金 | 492 | - | - | - | - | 492 |
| 2030 | 復興庁 | 環境省 | 福島県民健康管理基金 | 原子力被災者環境放射線モニタリング対策関連交付金 | 8 | 8 | 8 | 8 | 5 | 37 |
| 2033 | 文部科学省 | - | GIGAスクール構想加速化基金 | 公立学校情報機器整備事業費補助金 | - | - | - | - | 2643 | 2643 |
| - | 文部科学省 | - | 東京パラリンピック競技大会開催準備基金 | 東京パラリンピック競技大会開催準備交付金 | - | 150 | - | - | - | 150 |
| - | 文部科学省 | - | 新型コロナウイルス感染症対策基金 | 東京オリンピック・パラリンピック競技大会新型コロナウイルス感染症対策交付金 | - | 560 | - | - | - | 560 |
| - | 文部科学省 | - | ホストタウン等新型コロナウイルス感染症対策基金 | ホストタウン等新型コロナウイルス感染症対策交付金 | - | 126 | - | - | - | 126 |
| 2035 | 文部科学省 | - | 電源立地地域対策交付金基金 | 電源立地地域対策交付金 | - | 1 | 0 | 0 | 0 | 3 |
| 2038 | 厚生労働省 | - | 地域医療介護総合確保基金（医療分） | 医療介護提供体制改革推進交付金 | 688 | 628 | 571 | 526 | 647 | 3062 |
| 2040 | 厚生労働省 | - | 地域医療介護総合確保基金（介護分） | 医療介護提供体制改革推進交付金 | 436 | 530 | 549 | 549 | 489 | 2554 |
| 2042 | 厚生労働省 | - | 後期高齢者医療財政安定化基金 | 後期高齢者医療給付費等国庫負担金 | 13 | 16 | 16 | 11 | 10 | 68 |
| 2044 | 厚生労働省 | - | 国民健康保険財政安定化基金 | 国民健康保険財政安定化基金補助金 | - | 0 | 0 | - | 0 | 0 |
| 2045 | 農林水産省 | - | 農業構造改革支援基金 | 農地集積・集約化等対策事業費補助金 | - | - | 50 | 40 | 30 | 120 |
| 2054 | 経済産業省 | - | 電源立地地域対策交付金基金 | 電源立地地域対策交付金 | 41 | 33 | 63 | 73 | 75 | 287 |
| 2056 | 経済産業省 | - | 福島特定原子力施設地域振興交付金基金 | 福島特定原子力施設地域振興交付金 | 24 | 29 | 30 | 25 | 25 | 135 |
| 2057 | 経済産業省 | - | 原子力発電施設等立地地域基盤整備支援事業交付金基金 | 原子力発電施設等立地地域基盤整備支援事業交付金 | - | 5 | 0 | 0 | 13 | 20 |
| - | 環境省 | - | 平成30年7月豪雨における災害廃棄物処理基金事業 | 災害等廃棄物処理促進費補助金 | 1 | - | - | - | - | 1 |
| - | 環境省 | - | 令和2年7月豪雨における災害廃棄物処理基金 | 災害等廃棄物処理促進費補助金 | - | 3 | - | - | - | 3 |
| 2061 | 環境省 | - | 令和元年房総半島台風および令和元年東日本台風における災害廃棄物処理基金 | 災害等廃棄物処理促進費補助金 | 6 | - | - | - | - | 6 |
| 2062 | 環境省 | - | 令和6年能登半島地震における災害廃棄物処理基金 | 災害等廃棄物処理促進費補助金 | - | - | - | - | 8 | 8 |
| 2063 | 防衛省 | - | 再編関連特別地域整備事業により造成された基金 | 再編関連特別地域整備事業 | 19 | 25 | 21 | 25 | 34 | 126 |
| 計 | 2156 | 3723 | 2431 | 1684 | 4432 | 1兆4428 | ||||