平成２年度決算検査報告
この研究所は、原子力の開発に関する研究等を総合的かつ効率的に行うとともに、併せて原子力船の開発のために必要な研究を行い、原子力の研究、開発及び利用の促進に寄与することを目的として設置されているものである。その資本金は２事業年度末現在で１兆０５８１億６１４７万余円（うち国の出資１兆０５４７億２９６１万余円）となっている。
同研究所の２事業年度の収入支出決算、損益及び主な業務実績は次のとおりである。
１ 収入支出決算
| 区分 | 2事業年度 | (元事業年度) |
| (収入) | ||
収入決定済額 |
千円 125,439,491 |
千円 120,935,370 |
| (支出) | ||
| 支出予算現額 | 124,922,597 | 120,345,560 |
| 支出決定済額 | 111,940,772 | 104,292,145 |
| 翌事業年度繰越額 | 12,584,383 | 15,785,267 |
| 不用額 | 397,441 | 268,148 |
翌事業年度繰越額の主なものは、安全性研究費（支出予算現額１４２億５５３１万余円）の５４億９７３９万余円、原子力研究費（同１９５億９８２６万余円）の２６億９３０９万余円及び原子炉費（同１２１億２６２６万余円）の２１億６９９９万余円である。
２ 損益
| 区分 | 2事業年度 | (元事業年度) |
| 千円 | 千円 | |
| 経常収益 | 37,818,910 | 35,183,310 |
| (うち国庫補助金収入) | (27,134,754) | (25,373,832) |
| 経常費用 | 110,368,013 | 110,616,481 |
| (うち試験研究費) | (92,004,535) | (95,685,530) |
| 特別利益 | 143,707 | 560,156 |
| 特別損失 | 3,874,587 | 9,148,215 |
| 当期損失金 | 76,279,982 | 84,021,229 |
| (損失金の処理) | ||
| 翌事業年度に繰越欠損金として整理 | 76,279,982 | 84,021,229 |
| (繰越欠損金 | 648,840,759 | 564,819,529) |
３ 主な業務実績
核融合に関する研究
原子力利用の安全性の研究
原子力船「むつ」の試験等