この特別会計は、国が施行する特定の土地改良事業について資金調達の円滑化を図り、経済的な進度で工事を実施することを目的として、これらの工事に関する経理を一般会計と区分して行うため設置されているものである。
53年度の歳入歳出決算についてみると、歳入では、徴収決定済額1303億3823万余円、収納済歳入額1301億2217万余円、収納未済歳入額2億1605万余円、歳出では、支出済歳出額1277億1337万余円、翌年度繰越額37億6425万余円、不用額24億1694万余円となっている。
収納未済歳入額はすべて土地改良事業費負担金収入(徴収決定済額83億2043万余円)の分であり、また、翌年度繰越額はすべて土地改良事業費(歳出予算現額1037億7674万余円)の分であり、不用額の主なものは土地改良事業費の7億3192万余円である。
前記の支出に係る業務実績は、かんがい排水事業41地区、干拓事業7地区、農用地開発事業6地区の実施である。
なお、53年度末における借入金の現在額は2561億3007万余円(全額資金運用部資金からの借入金)となっている。