会計検査院は、下記の特別会計の決算額を確認した。
| 所管及び会計名 | 歳入 | 歳出 |
| 円 | 円 | |
| 総理府、大蔵省及び通商産業省 | ||
| 電源開発促進対策 | ||
| 電源立地勘定 | 105,521,646,440 | 51,890,106,399 |
| 電源多様化勘定 | 114,326,518,510 | 72,843,829,526 |
| 大蔵省 | ||
| 造幣局 | 19,613,137,373 | 19,588,921,202 |
| 印刷局 | 62,091,430,084 | 56,100,219,503 |
| 資金運用部 | 7,770,549,311,518 | 7,764,018,318,516 |
| 国債整理基金 | 24,308,603,429,358 | 20,794,265,973,277 |
| 外国為替資金 | 1,153,000,562,927 | 545,356,188,469 |
| 産業投資 | 39,517,578,660 | 24,876,821,645 |
| 地震再保険 | 17,164,273,812 | 35,755,333 |
| 大蔵省及び自治省 | ||
| 交付税及び譲与税配付金 | 17,409,118,144,148 | 17,386,091,575,045 |
| 大蔵省、通商産業省及び労働省 | ||
| 石炭並びに石油及び石油代替エネルギー対策 | ||
| 石炭勘定 | 144,546,196,305 | 125,366,373,452 |
| 石油及び石油代替エネルギー勘定 | 389,985,365,210 | 345,408,390,952 |
| 大蔵省及び建設省 | ||
| 特定国有財産整備 | 133,738,623,603 | 88,872,677,697 |
| 文部省 | ||
| 国立学校 | 1,461,711,143,402 | 1,407,639,810,082 |
| 厚生省 | ||
| 厚生保険 | ||
| 健康勘定 | 3,769,419,728,434 | 3,772,081,690,168 |
| 日雇健康勘定 | 636,269,576,910 | 636,507,644,649 |
| 年金勘定 | 8,391,573,757,789 | 4,096,468,544,578 |
| 児童手当勘定 | 143,389,210,003 | 124,941,661,811 |
| 業務勘定 | 322,365,584,607 | 317,294,790,020 |
| 船員保険 | 240,356,543,293 | 222,390,982,408 |
| 国立病院 | ||
| 病院勘定 | 307,850,874,216 | 301,430,462,752 |
| 療養所勘定 | 264,264,767,172 | 259,559,742,735 |
| あへん | 1,882,046,035 | 477,781,381 |
| 国民年金 | ||
| 国民年金勘定 | 2,060,075,023,066 | 1,866,362,382,773 |
| 福祉年金勘定 | 1,223,338,142,449 | 1,074,447,705,667 |
| 業務勘定 | 1,335,258,584,903 | 1,331,385,572,724 |
| 農林水産省 | ||
| 食糧管理 | ||
| 国内米管理勘定 | 3,576,290,162,972 | 3,574,055,532,737 |
| 国内麦管理勘定 | 141,236,422,531 | 141,226,843,573 |
| 輸入食糧管理勘定 | 350,314,863,152 | 348,623,091,344 |
| 農産物等安定勘定 | 12,205,979,520 | 12,205,979,520 |
| 輸入飼料勘定 | 172,350,536,310 | 172,314,546,398 |
| 業務勘定 | 159,353,912,656 | 159,213,302,587 |
| 調整勘定 | 4,794,840,371,385 | 4,794,840,371,385 |
| 農業共済再保険 | ||
| 再保険金支払基金勘定 | 2,647,774,005 | 253,075,000 |
| 農業勘定 | 112,172,930,979 | 112,058,312,239 |
| 家畜勘定 | 31,570,332,557 | 22,679,568,143 |
| 果樹勘定 | 17,994,506,147 | 14,126,408,526 |
| 園芸施設勘定 | 3,474,461,590 | 1,294,424,006 |
| 業務勘定 | 930,764,531 | 930,764,321 |
| 森林保険 | 10,049,553,444 | 3,592,762,544 |
| 漁船再保険及漁業共済保険 | ||
| 漁船普通保険勘定 | 33,974,140,411 | 21,129,484,165 |
| 漁船特殊保険勘定 | 282,757,369 | 235,300,355 |
| 漁船乗組員給与保険勘定 | 44,396,312 | 12,558,496 |
| 漁業共済保険勘定 | 8,580,657,666 | 7,257,323,735 |
| 業務勘定 | 757,866,870 | 757,683,687 |
| 自作農創設特別措置 | 35,027,707,444 | 6,605,503,731 |
| 国有林野事業 | ||
| 国有林野事業勘定 | 441,058,034,110 | 446,670,602,514 |
| 治山勘定 | 157,777,266,239 | 157,683,781,147 |
| 特定土地改良工事 | 150,323,383,088 | 148,221,045,025 |
| 通商産業省 | ||
| アルコール専売事業 | 37,244,471,486 | 30,228,971,365 |
| 輸出保険 | 185,839,782,166 | 40,235,464,112 |
| 機械類信用保険 | 9,155,293,235 | 2,790,347,859 |
| 運輸省 | ||
| 自動車損害賠償責任再保険 | ||
| 保険勘定 | 1,555,060,710,345 | 359,611,558,737 |
| 保障勘定 | 67,118,319,982 | 5,421,499,224 |
| 業務勘定 | 1,046,044,171 | 1,022,040,842 |
| 港湾整備 | ||
| 港湾整備勘定 | 317,782,186,270 | 315,677,945,575 |
| 特定港湾施設工事勘定 | 13,991,937,398 | 13,669,919,576 |
| 自動車検査登録 | 34,484,588,544 | 26,531,982,959 |
| 空港整備 | 245,919,014,679 | 228,101,109,844 |
| 郵政省 | ||
| 郵政事業 | 3,908,684,775,703 | 3,864,382,778,297 |
| 郵便貯金 | 4,873,357,487,821 | 4,873,344,842,488 |
| 簡易生命保険及郵便年金 | ||
| 保険勘定 | 4,442,746,557,955 | 2,067,475,476,255 |
| 年金勘定 | 37,734,413,797 | 11,907,903,942 |
| 労働省 | ||
| 労働保険 | ||
| 労災勘定 | 1,332,687,437,641 | 834,561,466,796 |
| 雇用勘定 | 1,453,148,735,217 | 1,445,325,481,272 |
| 徴収勘定 | 2,033,521,205,430 | 2,030,939,371,922 |
| 建設省 | ||
| 道路整備 | 2,184,920,296,010 | 2,173,235,190,872 |
| 治水 | ||
| 治水勘定 | 932,887,614,157 | 924,519,898,683 |
| 特定多目的ダム建設工事勘定 | 206,723,175,077 | 194,059,610,636 |
| 都市開発資金融通 | 46,750,500,331 | 46,246,173,429 |
| 計 | 105,959,594,528,930 | 92,320,981,222,627 |