この特別会計は、地方交付税及び地方譲与税の配付に関する経理を一般会計と区分して行うため設置されているものである。
56年度の歳入歳出決算についてみると、歳入では、徴収決定済額、収納済歳入額ともに17兆4091億1814万余円、歳出では、支出済歳出額17兆3860億9157万余円、不用額295億9908万余円となっている。不用額の主なものは、国債整理基金特別会計へ繰入(歳出予算現額8兆2503億2300万円)の 268 億1598万余円及び地方譲与税譲与金(同4485億円)の25億3478万余円である。
上記の支出によって交付した地方交付税は、総額8兆7166億1933万余円であり、このうち、道府県分は総額4兆6432億8276万余円、市町村分は総額4兆0733億3656万余円となっている。また、譲与した地方譲与税(地方道路譲与税、石油ガス譲与税、航空機燃料譲与税、自動車重量譲与税及び特別とん譲与税)は、総額4459億6521万余円であり、このうち、都道府県分は総額1756億9741万余円、市町村分は総額2702億6780万余円となっている。
なお、56年度末における借入金の現在額は7兆8730億4800万円(全額資金運用部資金からの借入金)となっている。