会計検査院は、下記の特別会計の決算額を確認した。
| 所管及び会計名 | 歳入 | 歳出 |
| 円 | 円 | |
| 総理府、大蔵省及び通商産業省 | ||
| 電源開発促進対策 | ||
| 電源立地勘定 | 143,486,089,509 | 64,736,985,772 |
| 電源多様化勘定 | 219,007,925,898 | 146,546,758,165 |
| 総理府、大蔵省及び自治省 | ||
| 交付税及び譲与税配付金 | ||
| 交付税及び譲与税配付金勘定 | 16,041,899,784,995 | 15,961,913,902,519 |
| 交通安全対策特別交付金勘定 | 75,045,944,219 | 69,690,582,222 |
| 法務省 | ||
| 登記 | 58,160,209,840 | 53,674,587,266 |
| 大蔵省 | ||
| 造幣局 | 16,559,126,102 | 16,556,681,490 |
| 印刷局 | 80,777,143,346 | 67,895,743,221 |
| 資金運用部 | 11,489,228,769,883 | 11,483,703,576,367 |
| 国債整理基金 | 32,626,424,877,944 | 30,235,362,214,356 |
外国為替資金 |
858,878,344,146 | 515,044,895,951 |
| 産業投資 | 100,152,842,662 | 57,048,466,103 |
| 地震再保険 | 22,627,543,558 | 40,660,294 |
大蔵省、通商産業省及び労働省 |
||
| 石炭並びに石油及び石油代替エネルギー対策 | ||
| 石炭勘定 | 149,194,075,901 | 118,282,531,952 |
| 石油及び石油代替エネルギー勘定 | 578,261,706,501 | 375,277,738,363 |
| 大蔵省及び建設省 | ||
| 特定国有財産整備 | 127,051,077,093 | 77,449,293,965 |
| 文部省 | ||
| 国立学校 | 1,676,095,980,279 | 1,612,597,530,680 |
| 厚生省 | ||
| 厚生保険 | ||
| 健康勘定 | 5,201,813,815,285 | 4,907,949,131,293 |
| 年金勘定 | 11,759,870,121,471 | 6,461,473,228,546 |
| 児童手当勘定 | 140,933,835,178 | 128,329,813,261 |
| 業務勘定 | 429,662,305,664 | 419,797,642,148 |
| 船員保険 | 309,670,031,358 | 300,053,782,077 |
| 国立病院 | ||
| 病院勘定 | 364,189,009,852 | 361,828,894,083 |
| 療養所勘定 | 305,009,730,620 | 299,185,075,408 |
| 国民年金 | ||
| 国民年金勘定 | 2,732,327,978,012 | 2,688,380,265,248 |
| 福祉年金勘定 | 1,003,511,416,508 | 916,103,237,103 |
| 業務勘定 | 1,667,600,095,013 | 1,665,839,935,601 |
| 農林水産省 | ||
| 食糧管理 | ||
| 国内米管理勘定 | 2,767,678,043,526 | 2,755,317,336,590 |
| 国内麦管理勘定 | 216,938,028,081 | 216,516,597,486 |
| 輸入食糧管理勘定 | 450,433,824,817 | 448,512,251,456 |
| 農産物等安定勘定 | 1,840,658,432 | 1,840,658,432 |
| 輸入飼料勘定 | 133,313,892,923 | 132,723,029,523 |
| 業務勘定 | 145,654,476,399 | 144,694,292,961 |
| 調整勘定 | 3,102,908,959,085 | 3,102,908,959,085 |
| 農業共済再保険 | ||
| 再保険金支払基金勘定 | 9,643,727,398 | 0 |
| 農業勘定 | 73,745,340,654 | 24,889,135,107 |
| 家畜勘定 | 36,698,403,517 | 25,381,820,444 |
| 果樹勘定 | 9,106,276,631 | 4,911,385,931 |
| 園芸施設勘定 | 3,022,949,286 | 1,927,707,620 |
| 業務勘定 | 1,066,852,110 | 1,066,851,237 |
| 森林保険 | 11,740,130,349 | 3,182,696,090 |
| 漁船再保険及漁業共済保険 | ||
| 漁船普通保険勘定 | 33,980,797,958 | 24,325,477,290 |
| 漁船特殊保険勘定 | 220,277,250 | 83,735,400 |
| 漁船乗組員給与保険勘定 | 50,394,969 | 1,553,363 |
| 漁業共済保険勘定 | 7,472,839,797 | 7,227,636,801 |
| 業務勘定 | 830,322,316 | 830,308,888 |
| 農業経営基盤強化措置 | 23,972,788,298 | 16,453,386,097 |
| 国有林野事業 | ||
| 国有林野事業勘定 | 504,848,173,053 | 513,789,533,394 |
| 治山勘定 | 148,906,947,964 | 148,832,058,115 |
| 特定土地改良工事 | 180,833,060,566 | 178,355,968,756 |
| 通商産業省 | ||
| アルコール専売事業 | 37,812,506,040 | 26,960,363,976 |
| 輸出保険 | 200,551,281,587 | 170,533,984,437 |
| 特許 | 46,493,632,347 | 32,659,867,235 |
| 運輸省 | ||
| 自動車損害賠償責任再保険 | ||
| 保険勘定 | 1,576,300,663,753 | 455,048,439,301 |
| 保障勘定 | 92,447,214,447 | 6,491,627,280 |
| 業務勘定 | 1,462,534,970 | 1,366,939,529 |
| 港湾整備 | ||
| 港湾整備勘定 | 332,303,016,216 | 329,406,044,609 |
| 特定港湾施設工事勘定 | 27,847,175,687 | 27,419,152,213 |
| 自動車検査登録 | 40,049,667,649 | 30,289,790,390 |
| 空港整備 | 285,690,463,556 | 242,873,396,636 |
| 郵政省 | ||
| 郵政事業 | 4,417,296,899,460 | 4,417,256,233,939 |
| 郵便貯金 | 7,122,902,194,430 | 6,894,172,141,053 |
| 簡易生命保険及郵便年金 | ||
| 保険勘定 | 6,767,025,398,653 | 3,876,482,149,570 |
| 年金勘定 | 148,218,463,988 | 17,252,535,144 |
| 労働省 | ||
| 労働保険 | ||
| 労災勘定 | 1,619,886,582,244 | 978,968,683,149 |
| 雇用勘定 | 1,758,264,087,339 | 1,397,716,517,569 |
| 徴収勘定 | 2,478,769,462,721 | 2,477,096,729,959 |
| 建設省 | ||
| 道路整備 | 2,487,036,974,075 | 2,461,977,980,023 |
| 治水 | ||
| 治水勘定 | 931,709,137,498 | 918,043,571,683 |
| 特定多目的ダム建設工事勘定 | 214,982,552,459 | 206,569,333,310 |
| 都市開発資金融通 | 48,123,167,251 | 48,062,094,640 |
| 計 | 126,677,520,022,586 | 111,775,183,109,165 |