平成１６年度決算検査報告
この独立行政法人は、生物資源の農業上の開発及び利用に関する技術上の基礎的な調査及び研究、昆虫その他の無脊椎動物の農業上の利用に関する技術上の試験及び研究等を行うことにより、生物の農業上の利用に関する技術の向上に寄与することを目的として設置されているものである。その資本金は１６事業年度末現在で４０３億１９０６万余円（全額国の出資）となっている。
同法人の１６事業年度の貸借対照表、損益計算書及び主な業務実績は次のとおりである。
１ 貸借対照表
| 区分 | 16事業年度末 | (15事業年度末) |
| 千円 | 千円 | |
| 資産 | 44,721,561 | 45,189,129 |
| (うち建物) | (14,052,221) | (14,233,035) |
| (うち土地) | (23,780,216) | (23,780,216) |
| 負債 | 3,583,061 | 7,415,359 |
| (うち運営費交付金債務) | (191,497) | (120,020) |
| (うち未払金) | (514,776) | (371,293) |
| (うち資産見返負債) | (2,162,471) | (2,225,574) |
| 資本 | 41,138,499 | 37,773,770 |
| (うち資本金) | (40,319,066) | (40,319,066) |
| (うち資本剰余金) | (△669,513)(注) | (△4,128,876) |
| (うち利益剰余金) | (1,488,947) | (1,583,580) |
２ 損益計算書
| 区分 | 16事業年度 | (15事業年度) |
| 千円 | 千円 | |
| 経常費用 | 12,375,711 | 12,777,542 |
| (うち研究業務費) | (11,143,464) | (11,479,881) |
| 経常収益 | 12,385,683 | 12,680,333 |
| (うち運営費交付金収益) | (7,222,165) | (7,203,028) |
| (うち受託収入) | (4,357,981) | (4,711,190) |
| 経常利益(△経常損失) | 9,972 | △97,208 |
| 臨時損失 | 110,879 | 3,358 |
| 臨時利益 | 6,273 | 4,586 |
| 当期純損失 | 94,633 | 95,980 |
| 当期総損失 | 94,633 | 95,980 |
| (損失の処理) | ||
| (当期未処理損失) | ||
| 当期総損失 | 94,633 | 95,980 |
| (損失処理額) | ||
| 積立金取崩額 | 94,633 | 95,980 |
３ 主な業務実績
| 区分 | 16事業年度 | (15事業年度) |
| 千円 | 千円 | |
| 基盤研究部門のうちの植物関係研究及び植物生命科学研究部門 | 6,201,479 | 6,975,313 |
| 基盤研究部門のうちの昆虫関係研究及び昆虫・動物生命科学研究部門のうちの昆虫関係研究 | 2,661,916 | 2,551,790 |
| 基盤研究部門のうちの動物関係研究及び昆虫・動物生命科学研究部門のうちの動物関係研究 | 1,000,993 | 1,028,683 |
なお、この法人について検査した結果、「第３章 個別の検査結果」に「埋設温水管改修工事の実施に当たり、監督が十分でなかったなどのため山留工が施工されていないもの」 及び「研究用機器の購入契約に当たり、公正性及び競争性の確保を図るため、競争に付するなど契約事務を適切に実施するよう改善させたもの」 を掲記した。