会計検査院は、下記の特別会計の決算額を確認した。
| 所管及び会計名 | 歳入 | 歳出 |
| 円 | 円 | |
| 総理府、大蔵省及び通商産業省 | ||
| 電源開発促進対策 | ||
| 電源立地勘定 | 319,594,942,866 | 155,220,506,296 |
| 電源多様化勘定 | 266,455,465,811 | 206,851,287,994 |
| 総理府、大蔵省及び自治省 | ||
| 交付税及び譲与税配付金 | ||
| 交付税及び譲与税配付金勘定 | 21,930,854,684,568 | 21,441,722,395,963 |
| 交通安全対策特別交付金勘定 | 94,532,795,250 | 87,846,185,407 |
| 法務省 | ||
| 登記 | 167,984,394,096 | 147,431,691,731 |
| 大蔵省 | ||
| 造幣局 | 26,127,660,671 | 23,181,975,818 |
| 印刷局 | 98,604,260,205 | 90,151,056,350 |
| 資金運用部 | 18,376,901,222,738 | 18,242,878,514,014 |
| 国債整理基金 | 53,189,704,377,097 | 46,342,973,710,928 |
| 外国為替資金 | 1,199,795,689,190 | 340,157,207,085 |
| 産業投資 | ||
| 産業投資勘定 | 128,089,828,599 | 83,870,843,153 |
| 社会資本整備勘定 | 2,505,444,326,353 | 2,451,251,406,248 |
| 地震再保険 | 33,832,446,653 | 60,401,120 |
| 大蔵省、通商産業省及び労働省 | ||
| 石炭並びに石油及びエネルギー需給構造高度化対策 | ||
| 石炭勘定 | 129,875,568,468 | 88,475,748,667 |
| 石油及びエネルギー需給構造高度化勘定 | 742,372,356,700 | 461,364,353,701 |
| 大蔵省及び建設省 | ||
| 特定国有財産整備 | 194,487,580,604 | 161,183,485,280 |
| 文部省 | ||
| 国立学校 | 2,640,636,115,213 | 2,501,640,023,710 |
| 厚生省 | ||
| 厚生保険 | ||
| 健康勘定 | 8,134,164,802,138 | 8,156,425,344,605 |
| 年金勘定 | 34,720,567,442,091 | 28,062,799,520,394 |
| 制度間調整勘定 | 9,595,455,552,767 | 9,595,455,552,767 |
| 児童手当勘定 | 212,349,193,411 | 200,168,932,383 |
| 業務勘定 | 668,857,097,796 | 652,718,995,967 |
| 船員保険 | 111,902,965,126 | 104,488,911,741 |
| 国立病院 | ||
| 病院勘定 | 616,315,901,807 | 585,322,864,553 |
| 療養所勘定 | 487,024,604,664 | 450,334,545,327 |
| 国民年金 | ||
| 基礎年金勘定 | 11,131,225,397,998 | 9,969,769,148,824 |
| 国民年金勘定 | 6,491,172,920,313 | 5,815,184,430,020 |
| 福祉年金勘定 | 229,248,383,734 | 201,950,503,366 |
| 業務勘定 | 1,838,527,942,523 | 1,833,289,411,923 |
| 農林水産省 | ||
| 食糧管理 | ||
| 国内米管理勘定 | 771,418,083,345 | 758,380,533,660 |
| 国内麦管理勘定 | 104,260,717,354 | 102,765,716,008 |
| 輸入食糧管理勘定 | 600,941,553,618 | 598,406,333,355 |
| 農産物等安定勘定 | 0 | 0 |
| 輸入飼料勘定 | 78,962,472,844 | 75,875,475,994 |
| 業務勘定 | 124,153,424,765 | 123,142,573,971 |
| 調整勘定 | 671,216,528,798 | 671,216,528,798 |
| 農業共済再保険 | ||
| 再保険金支払基金 勘定 | 7,822,349,594 | 2,451,083,000 |
| 農業勘定 | 358,149,175,066 | 358,008,801,185 |
| 家畜勘定 | 52,113,256,142 | 36,290,756,930 |
| 果樹勘定 | 9,163,428,974 | 6,502,281,303 |
| 園芸施設勘定 | 4,101,033,890 | 3,003,716,930 |
| 業務勘定 | 1,313,713,718 | 1,313,713,647 |
| 森林保険 | 12,470,918,731 | 2,335,733,857 |
| 漁船再保険及漁業共済保険 | ||
| 漁船普通保険勘定 | 37,321,867,900 | 22,221,715,004 |
| 漁船特殊保険勘定 | 500,389,410 | 235,980,963 |
| 漁船乗組員給与保 険勘定 | 81,259,143 | 15,917,254 |
| 漁業共済保険勘定 | 17,260,861,684 | 14,408,594,684 |
| 業務勘定 | 1,072,263,703 | 1,072,252,384 |
| 農業経営基盤強化措置 | 88,103,864,400 | 24,091,262,863 |
| 国有林野事業 | ||
| 国有林野事業勘定 | 567,833,980,822 | 597,733,760,582 |
| 治山勘定 | 374,031,474,040 | 373,872,883,906 |
| 国営土地改良事業 | 550,187,213,050 | 530,802,545,664 |
| 通商産業省 | ||
| アルコール専売事業 | 44,580,863,249 | 27,909,473,769 |
| 貿易保険 | 789,015,332,624 | 788,738,254,301 |
| 特許 | 93,458,347,699 | 68,460,136,579 |
| 運輸省 | ||
| 自動車損害賠償責任再保険 | ||
| 保険勘定 | 3,463,439,919,713 | 1,308,860,397,882 |
| 保障勘定 | 142,693,139,017 | 38,833,242,966 |
| 業務勘定 | 2,297,892,122 | 2,220,101,721 |
| 港湾整備 | ||
| 港湾整備勘定 | 726,645,471,119 | 697,985,140,326 |
| 特定港湾施設工事勘定 | 21,950,515,449 | 21,710,313,775 |
| 自動車検査登録 | 54,419,548,546 | 43,464,498,875 |
| 空港整備 | 593,312,974,532 | 530,674,420,743 |
| 郵政省 | ||
| 郵政事業 | 6,970,337,123,509 | 6,931,915,257,577 |
| 郵便貯金 | ||
| 一般勘定 | 12,937,980,816,739 | 10,167,721,260,888 |
| 金融自由化対策特別勘定 | 6,371,245,833,525 | 6,363,733,199,339 |
| 簡易生命保険 | 17,536,820,868,596 | 9,264,354,615,866 |
| 労働省 | ||
| 労働保険 | ||
| 労災勘定 | 2,170,267,513,179 | 1,255,644,186,183 |
| 雇用勘定 | 2,566,634,869,636 | 2,364,306,246,788 |
| 徴収勘定 | 3,551,628,824,188 | 3,551,167,565,601 |
| 建設省 | ||
| 道路整備 | 5,661,404,359,985 | 5,412,038,639,108 |
| 治水 | ||
| 治水勘定 | 2,250,275,611,657 | 2,183,705,315,919 |
| 特定多目的ダム建設工事勘定 | 327,496,606,375 | 307,121,767,346 |
| 都市開発資金融通 | 157,419,808,467 | 156,521,106,097 |
| 計 | 247,147,911,990,367 | 214,245,102,258,956 |