平成１３年度決算検査報告
この独立行政法人は、家畜の改良及び増殖並びに飼養管理の改善、飼料作物の増殖に必要な種苗の生産及び配布等を行うことにより、優良な家畜の普及及び飼料作物の優良な種苗の供給の確保を図ることを目的として設置されているものである。その資本金は１３事業年度末現在で４８２億２７９６万余円（全額国の出資）となっている。
同法人の１３事業年度の貸借対照表、損益計算書及び主な業務実績は次のとおりである。
なお、同法人は、１３年４月１日、独立行政法人家畜改良センター法（平成１１年法律第１８５号）附則第５条の規定により国が有する権利及び義務のうち農林水産省の家畜改良センターに関する権利及び義務を承継して設立されたものである。
1 貸借対照表
| 区分 | 13事業年度末 | |
| 千円 | ||
| 資産 | 49,359,693 | |
| （うち建物） | (15,960,700) | |
| （うち土地） | (25,406,200) | |
| 負債 | 2,490,153 | |
| （うち未払金） | (1,005,405) | |
| （うち資産見返負債） | (1,396,152) | |
| 資本 | 46,869,539 | |
| （うち資本金） | (48,227,966) | |
| （うち資本剰余金） | (△1,527,783)（注） |
2 損益計算書
| 区分 | 13事業年度 | |
| 千円 | ||
| 経常費用 | 8,663,915 | |
| （うち業務費） | (6,600,441) | |
| 経常収益 | 8,776,795 | |
| （うち運営費交付金収益） | (7,513,241) | |
| （うち事業収益） | (408,885) | |
| 経常利益 | 112,880 | |
| 臨時損失 | 270,059 | |
| 臨時利益 | 326,534 | |
| 当期総利益 | 169,355 | |
| （利益の処分） | ||
| 積立金 | 134,723 | |
| 独立行政法人通則法第44条第3項により承認を受けようとする額 | ||
| 効率化及び質の向上積立金 | 34,631 |
３ 主な業務実績
| 区分 | 13事業年度 | |||
| 家畜の改良増殖 | 乳用牛 | 1,277頭 | ||
| 肉用牛 | 1,127頭 | |||
| 飼料作物 | 種苗の生産 | 38品種 | ||
| 種苗の配布 | 採種用 | 39品種 | ||
| 普及用 | 46品種 |
なお、この法人について検査した結果、「第３章 個別の検査結果」に「独立行政法人の会計経理について、資産及び費用等の認識・計上処理を適切に行い、正確な財務諸表等の作成を期するよう是正改善の処置を要求したもの」 を掲記した。