平成１３年度決算検査報告
この独立行政法人は、肥料、飼料及び飼料添加物並びに土壌改良資材の検査等を行うことにより、肥料、飼料及び土壌改良資材の品質の保全を図ることを目的として設置されているものである。その資本金は１３事業年度末現在で１６億７１２１万余円（全額国の出資）となっている。
同法人の１３事業年度の貸借対照表、損益計算書及び主な業務実績は次のとおりである。
なお、同法人は、１３年４月１日、独立行政法人肥飼料検査所法（平成１１年法律第１８６号）附則第５条の規定により国が有する権利及び義務のうち農林水産省の肥飼料検査所に関する権利及び義務を承継して設立されたものである。
１ 貸借対照表
| 区分 | 13事業年度末 | |
| 千円 | ||
| 資産 | 2,052,641 | |
| （うち建物） | (658,716) | |
| （うち土地） | (806,980) | |
| 負債 | 450,799 | |
| （うち運営費交付金債務） | (133,902) | |
| （うち資産見返負債） | (245,416) | |
| 資本 | 1,601,841 | |
| （うち資本金） | (1,671,210) | |
| （うち資本剰余金） | (△62,321)（注） |
２ 損益計算書
| 区分 | 13事業年度 | |
| 千円 | ||
| 経常費用 | 1,977,342 | |
| （うち業務費） | (1,516,721) | |
| 経常収益 | 1,972,192 | |
| （うち運営費交付金収益） | (1,668,248) | |
| （うち受託収入） | (7,256) | |
| 経常損失 | 5,149 | |
| 臨時損失 | 1,898 | |
| 当期総損失 | 7,047 | |
| （損失の処理） | ||
| 次期繰越損失 | 7,047 |
３ 主な業務実績
| 区分 | 13事業年度 | |
| (1)肥料の検査 | ||
| 肥料の登録又は仮登録の申請に係る調査 | ||
| 新規登録 | 1,498件 | |
| 登録更新 | 3,891件 | |
| (2)飼料及び飼料添加物関係 | ||
| 飼料の安全性を向上させるためなどのモニタリング検査 | ||
| 飼料及び飼料添加物中の抗菌性飼料添加物の基準・規格適合検査 | 1,207点 | |
| 飼料中の有害物質の基準適合検査 | 8,643点 | |
| 飼料中の病原微生物の基準・規格適合検査 | 481点 | |
なお、この法人について検査した結果、「第３章 個別の検査結果」に「独立行政法人の会計経理について、資産及び費用等の認識・計上処理を適切に行い、正確な財務諸表等の作成を期するよう是正改善の処置を要求したもの」 を掲記した。