平成１４年度決算検査報告
この研究所は、科学技術に関する試験研究を総合的に行い、及びその成果を普及することを目的として設置されているものである。その資本金は１４事業年度末現在で６２１２億９６７５万余円（うち国の出資５８８６億２８０６万余円）となっている。
同研究所の１４事業年度の収入支出決算、損益及び主な業務実績は次のとおりである。
１ 収入支出決算
| 区分 | 14事業年度 | (13事業年度) |
| 千円 | 千円 | |
| (収入) | ||
| 収入決定済額 | 107,992,655 | 130,380,583 |
| (支出) | ||
| 支出予算現額 | 112,115,724 | 133,165,114 |
| 支出決定済額 | 106,382,144 | 114,585,365 |
| 翌事業年度繰越額 | 5,646,101 | 15,131,308 |
| 不用額 | 87,478 | 3,448,440 |
２ 損益
| 区分 | 14事業年度 | (13事業年度) |
| 千円 | 千円 | |
| 経常収益 | 70,430,003 | 20,166,053 |
| (うち国庫補助金収入) | (48,994,428) | (10,651,331) |
| 経常費用 | 101,888,631 | 87,080,150 |
| (うち研究費) | (88,848,875) | (74,877,857) |
| 特別損失 | 368,686 | 212,714 |
| 当期損失金 | 31,827,314 | 67,126,811 |
| (損失金の処理) | ||
| 翌事業年度に繰越欠損金として整理 | 31,827,314 | 67,126,811 |
| (繰越欠損金 | 374,566,496 | 307,439,685) |
３ 主な業務実績
| 区分 | 14事業年度 | (13事業年度) |
| 千円 | 千円 | |
| 先導的・基盤的研究 | 5,754,727 | 6,738,602 |
| 脳科学総合研究 | 4,210,179 | 4,738,986 |
| ゲノム科学総合研究 | 4,687,970 | 9,455,146 |
| 発生・再生研究 | 1,855,845 | 5,271,018 |
なお、この研究所について検査した結果、「第３章 個別の検査結果」に「物品の管理が適切なものとなるよう是正改善の処置を要求したもの」 を掲記した。