この特別会計は、地方交付税及び地方譲与税の配付に関する経理を一般会計と区分して行うため設置されているものである。
52年度の歳入歳出決算についてみると、歳入では、徴収決定済額、収納済歳入額ともに8兆7951億6443万余円、歳出では、支出済歳出額8兆7926億5088万余円、不用額49億9624万余円となっている。不用額の主なものは国債整理基金特別会計へ繰入(歳出予算現額2兆7475億9454万余円)の36億3747万余円である。
上記の支出によって交付した地方交付税は、総額5兆7054億5766万余円であり、このうち道府県分は総額3兆0969億8021万余円、市町村分は総額2兆6084億7744万余円となっている。また、譲与した地方譲与税(地方道路譲与税、石油ガス譲与税、航空機燃料譲与税、自動車重量譲与税及び特別とん譲与税)は、総額3432億3614万余円であり、このうち都道府県分は総額1656億6029万余円、市町村分は総額1775億7585万余円となっている。
なお、52年度末における借入金の現在額は3兆6256億4000万円(全額資金運用部資金からの借入金)となっている。