会計検査院は、下記の特別会計の決算額を確認した。
| 所管及び会計名 | 歳入 | 歳出 | 
総理府、大蔵省及び通商産業省  | 
円 | 
円 | 
| 電源開発促進対策 | ||
| 電源立地勘定 | 196,328,502,722 | 61,458,518,607 | 
| 電源多様化勘定 | 222,939,618,137 | 162,666,627,714 | 
| 総理府、大蔵省及び自治省 | ||
| 交付税及び譲与税配付金 | ||
| 交付税及び譲与税配付金勘定 | 17,678,470,352,096 | 17,496,466,954,744 | 
| 交通安全対策特別交付金勘定 | 109,060,405,748 | 100,863,666,080 | 
| 法務省 | ||
| 登記 | 102,135,841,743 | 89,495,990,615 | 
| 大蔵省 | ||
| 造幣局 | 19,906,330,007 | 19,884,377,857 | 
| 印刷局 | 81,557,546,197 | 69,137,512,051 | 
| 資金運用部 | 13,035,072,199,193 | 13,028,407,033,513 | 
| 国債整理基金 | 46,448,713,549,515 | 39,652,766,431,267 | 
| 外国為替資金 | 1,332,646,586,924 | 397,501,881,575 | 
| 産業投資 | ||
| 産業投資勘定 | 736,324,603,379 | 447,675,284,225 | 
| 社会資本整備勘定 | 458,011,781,000 | 384,741,942,412 | 
| 地震再保険 | 24,626,310,922 | 43,598,930 | 
| 大蔵省、通商産業省及び労働省 | ||
| 石炭並びに石油及び石油代替エネルギー対策 | ||
| 石炭勘定 | 145,843,524,243 | 123,064,053,836 | 
| 石油及び石油代替エネルギー勘定 | 535,642,869,977 | 298,692,794,905 | 
| 大蔵省及び建設省 | ||
| 特定国有財産整備 | 153,218,937,211 | 82,260,934,491 | 
| 文部省 | ||
| 国立学校 | 1,889,667,399,392 | 1,805,253,233,909 | 
| 厚生省 | ||
| 厚生保険 | ||
| 健康勘定 | 5,645,242,110,220 | 5,646,159,297,644 | 
| 年金勘定 | 16,508,058,919,981 | 12,189,993,028,854 | 
| 児童手当勘定 | 149,845,098,913 | 126,203,481,723 | 
| 業務勘定 | 449,516,075,271 | 434,486,415,247 | 
| 船員保険 | 115,272,344,406 | 119,332,621,887 | 
| 国立病院 | ||
| 病院勘定 | 410,194,771,245 | 402,332,718,442 | 
| 療養所勘定 | 353,668,318,448 | 331,698,191,598 | 
| 国民年金 | ||
| 基礎年金勘定 | 6,409,140,188,211 | 6,147,038,384,338 | 
| 国民年金勘定 | 5,188,209,461,613 | 4,524,402,948,628 | 
| 福祉年金勘定 | 617,213,836,988 | 527,558,225,010 | 
| 業務勘定 | 1,348,641,616,647 | 1,345,277,069,194 | 
| 農林水産省 | ||
| 食糧管理 | ||
| 国内米管理勘定 | 2,622,542,549,636 | 2,607,022,493,278 | 
| 国内麦管理勘定 | 197,174,694,829 | 195,756,393,991 | 
| 輸入食糧管理勘定 | 487,127,372,443 | 469,004,326,615 | 
| 農産物等安定勘定 | 1,726,702,774 | 1,726,702,774 | 
| 輸入飼料勘定 | 95,662,630,897 | 90,317,830,116 | 
| 業務勘定 | 141,052,242,990 | 140,395,092,730 | 
| 調整勘定 | 3,308,765,488,050 | 3,308,765,488,050 | 
| 農業共済再保険 | ||
| 再保険金支払基金勘定 | 10,949,519,263 | 0 | 
| 農業勘定 | 64,296,058,846 | 24,317,100,225 | 
| 家畜勘定 | 41,433,266,463 | 26,899,228,715 | 
| 果樹勘定 | 7,201,135,878 | 3,747,034,546 | 
| 園芸施設勘定 | 2,677,449,946 | 2,125,858,461 | 
| 業務勘定 | 1,106,620,291 | 1,099,698,405 | 
| 森林保険 | 11,966,668,708 | 3,097,125,768 | 
| 漁船再保険及漁業共済保険 | ||
| 漁船普通保険勘定 | 38,768,827,871 | 23,404,756,970 | 
| 漁船特殊保険勘定 | 316,161,059 | 123,285,000 | 
| 漁船乗組員給与保険勘定 | 55,658,927 | 9,128,797 | 
| 漁業共済保険勘定 | 12,179,330,164 | 11,000,511,164 | 
| 業務勘定 | 842,900,259 | 842,896,777 | 
| 農業経営基盤強化措置 | 51,252,252,912 | 14,142,211,388 | 
| 国有林野事業 | ||
| 国有林野事業勘定 | 552,948,817,176 | 546,709,995,679 | 
| 治山勘定 | 180,300,615,488 | 180,211,800,727 | 
| 国営土地改良事業 | 441,622,512,544 | 436,054,920,903 | 
| 通商産業省 | ||
| アルコール専売事業 | 32,362,819,636 | 21,824,988,608 | 
| 貿易保険 | 318,074,230,819 | 287,003,410,924 | 
| 特許 | 69,625,193,645 | 49,304,652,840 | 
| 運輸省 | ||
| 自動車損害賠償責任再保険 | ||
| 保険勘定 | 2,126,476,492,984 | 465,642,836,280 | 
| 保障勘定 | 109,296,749,402 | 7,691,775,202 | 
| 業務勘定 | 1,625,863,038 | 1,543,515,554 | 
| 港湾整備 | ||
| 港湾整備勘定 | 386,067,878,144 | 382,574,285,974 | 
| 特定港湾施設工事勘定 | 19,767,234,957 | 19,548,364,535 | 
| 自動車検査登録 | 42,997,908,881 | 30,885,269,585 | 
| 空港整備 | 334,244,548,922 | 256,047,294,453 | 
| 郵政省 | ||
| 郵政事業 | 5,122,560,441,037 | 5,091,532,370,992 | 
| 郵便貯金 | ||
| 一般勘定 | 8,608,519,220,731 | 8,003,728,717,097 | 
| 金融自由化対策特別勘定 | 2,039,494,888,620 | 2,039,143,095,540 | 
| 簡易生命保険及郵便年金 | ||
| 保険勘定 | 8,594,007,672,010 | 4,548,106,425,605 | 
| 年金勘定 | 243,356,286,355 | 29,755,746,548 | 
| 労働省 | ||
| 労働保険 | ||
| 労災勘定 | 1,771,053,014,032 | 1,008,789,976,708 | 
| 雇用勘定 | 1,876,652,524,029 | 1,604,861,896,648 | 
| 徴収勘定 | 2,661,779,365,649 | 2,659,946,770,400 | 
| 建設省 | ||
| 道路整備 | 3,160,602,757,887 | 3,110,985,111,876 | 
| 治水 | ||
| 治水勘定 | 1,144,396,237,893 | 1,126,786,117,341 | 
| 特定多目的ダム建設工事勘定 | 278,616,792,842 | 268,379,808,768 | 
| 都市開発資金融通 | 89,146,212,778 | 89,069,717,960 | 
| 計 | 167,667,862,912,054 | 145,204,789,249,813 |