平成１５年度決算検査報告
この独立行政法人は、自動車の検査に関する事務のうち、自動車が保安基準に適合するかどうかの審査を行うことにより、自動車の安全性の確保及び自動車による公害の防止その他の環境の保全を図ることを目的として設置されているものである。その資本金は１５事業年度末現在で１２０億３０９７万余円（全額国の出資）となっている。
同法人の１５事業年度の貸借対照表、損益計算書及び主な業務実績は次のとおりである。
１ 貸借対照表
| 区分 | 15事業年度末 | (14事業年度末) |
| 千円 | 千円 | |
| 資産 | 25,321,821 | 22,337,054 |
| (うち建物) | (11,737,284) | (11,105,461) |
| (うち土地) | (366,378) | (366,378) |
| 負債 | 12,180,707 | 10,246,741 |
| (うち未払金) | (2,294,712) | (952,847) |
| (うち資産見返負債) | (8,165,887) | (7,384,599) |
| 資本 | 13,141,114 | 12,090,313 |
| (うち資本金) | (12,030,976) | (12,030,976) |
| (うち資本剰余金) | (892,451)(注1) | (△148,867) |
（注１） 損益外減価償却累計額△１，３３３，７２９千円が含まれている。
２ 損益計算書
| 区分 | 15事業年度 | (14事業年度) |
| 千円 | 千円 | |
| 経常費用 | 10,275,228 | 7,889,781 |
| (うち検査業務費) | (9,314,731) | (6,873,860) |
| 経常収益 | 10,281,688 | 7,895,543 |
| (うち運営費交付金収益) | (8,757,496) | (5,925,206) |
| (うち受託収入) | (4,776) | (4,203) |
| 経常利益 | 6,459 | 5,762 |
| 臨時利益 | 3,022 | 202,441 |
| 当期純利益 | 9,482 | 208,204 |
| 当期総利益 | 9,482 | 208,204 |
| (利益の処分) | ||
| (当期未処分利益) | ||
| 当期総利益 | 9,482 | 208,204 |
| (利益処分額) | ||
| 積立金 | 9,482 | 208,204 |
（注２）自動車検査独立行政法人の１４事業年度は、１４年７月１日から１５年３月３１日までである。
３ 主な業務実績
| 区分 | 15事業年度 | (14事業年度) |
| 件 | 件 | |
| 保安基準適合性審査 | 8,845,941 | 6,484,769 |
なお、この独立行政法人について検査した結果、「第３章 個別の検査結果」に「消費税の申告に当たり、課税仕入れの額を過小に算出していたことなどにより、還付を受けた消費税の額が不足していたもの」 を、「第４章 特定検査対象に関する検査状況」に「独立行政法人における還付消費税の処理及び納付消費税の会計処理について」 を掲記した。