平成１９年度決算検査報告
この独立行政法人は、医療の提供、医療に関する調査及び研究並びに技術者の研修等の業務を行うことにより、国民の健康に重大な影響のある疾病に関する医療その他の医療であって、国の医療政策として担うべきものの向上を図り、もって公衆衛生の向上及び増進に寄与することを目的として設置されているものである。その資本金は１９事業年度末現在で１４３７億５８２７万余円（全額国の出資）となっている。
同法人の１９事業年度の貸借対照表、損益計算書及び主な業務実績は次のとおりである。
（ア） 貸借対照表
区分
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19事業年度末
千円
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（18事業年度末）
千円
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資産
（うち建物）
（うち土地）
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1,160,129,313
（326,408,124）
（479,171,014）
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1,151,868,862
（338,360,603）
（479,228,302）
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負債
（うち運営費交付金債務）
（うち長期借入金）
（うち退職給付引当金）
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866,449,182
（1,391,061）
（589,773,957）
（76,691,086）
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887,230,139
（544,430）
（638,176,193）
（58,765,935）
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純資産（注1）
（うち資本金）
（うち資本剰余金）
（うち利益剰余金）
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293,680,131
（143,758,276）
（118,288,613）（注2）
（31,633,241）
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264,638,722
（143,758,276）
（113,139,241）
（7,741,204）
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（イ） 損益計算書
区分
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19事業年度
千円
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（18事業年度）
千円
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経常収益
（うち医業収益）
（うち運営費交付金収益）
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798,927,878
（731,184,138）
（48,769,889）
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767,665,829
（700,017,501）
（49,614,051）
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経常費用
（うち給与費）
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770,005,334
（437,016,739）
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755,258,765
（427,934,249）
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臨時利益
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365,915
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790,487
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臨時損失
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5,396,422
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4,222,538
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当期純利益
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23,892,037
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8,975,012
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当期総利益
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23,892,037
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8,975,012
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（利益の処分）
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（当期未処分利益）
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当期総利益
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23,892,037
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8,975,012
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前期繰越欠損金
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−
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1,233,808
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（利益処分額）
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積立金
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23,892,037
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−
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独立行政法人通則法第44条第3項により主務大臣の承認を受けた額
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施設設備整備積立金
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−
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7,741,204
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（ウ） 主な業務実績
区分
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19事業年度
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（18事業年度）
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病院数
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146か所
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146か所
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入院患者延べ数
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16,835千人
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17,016千人
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外来患者延べ数
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12,215千人
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12,352千人
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なお、この法人について検査した結果、「第３章 個別の検査結果」に「診療収入の収納事務の体制等が適切でなく、病院の収入となるべき現金が領得されるなど会計経理が著しく適正を欠いているもの 」を、「第４章 国会及び内閣に対する報告並びに国会からの検査要請事項に関する報告等」に「国及び国が資本金の２分の１以上を出資している法人における談合等に係る違約金条項の導入状況等について 」及び「独立行政法人の業務、財務、入札、契約の状況について 」を掲記した。